Ilgų nekoduojančių RNR molekulių vieno nukleotido polimorfizmų tyrimai skrandžio vėžiu sergančiųjų grupėje

Abstract

Įžanga Ilgos nekoduojančios RNR (angl. long non-coding RNA; lncRNR) yra >200 nukleotidų dydžio molekulės, kurios pasižymi žemu raiškos lygiu [1] bei nekonservatyvia struktūra [2]. Šios molekulės labai svarbios įvairių genominių funkcijų (genų raiškos, splaisingo ir t.t.) bei epigenetinių ir biologinių procesų reguliacijoje [3]. Įvairūs lncRNR raiškos pakitimai ir polimorfizmai yra siejami su įvairių rūšių navikiniais susirgimais, tarp jų ir skrandžio vėžiu [4]. Skrandžio vėžys yra viena iš letaliausių vėžio formų tiek Lietuvoje, tiek pasaulyje. Žinomi skrandžio vėžio rizikos veiksniai: Helicobacter pylori infekcija, aplinkos veiksniai, genetika, kopijų skaičiaus ir vieno nukleotido polimorfizmai, miRNR profilio pokyčiai bei paveldimumas [5]. Siekiant pagerinti sunkiai diagnozuojamų ligų, tokių kaip skrandžio vėžys, nustatymą ieškoma naujų biožymenų. Pastaraisiais metais atliekama daugybė tyrimų, susijusių su vieno nukleotido polimorfizmais ilgose nekoduojančiose RNR bei įvairių tipų vėžiu, o jų rezultatai rodo, jog tokių polimorfizmų atsiradimas didina vėžio riziką. Tuo tarpu tyrimų, ieškančių sąsajų tarp skrandžio vėžio bei lncRNR VNP, kol kas yra vos keletas. Tikslas Ištirti su skrandžio vėžio patogeneze siejamų ilgų nekoduojančių RNR polimorfizmų įtaką skrandžio vėžio išsivystymui. Metodai Iš viso tyrimo metu ištirta 990 аsmenų: kontrolinė grupė (n=484)-asmenys, kuriems dėl dispepsinių simptomų buvo аtliktа viršutinės virškinаmojo trаkto dаlies endoskopijа ir аnksčiаu nebuvo nustаtytа piktybinių nаvikų; skrandžio vėžio (GC) grupė (n=506)-asmenys, kuriems histologiškаi buvo pаtvirtintа skrаndžio аdenokаrcinomа. Atvejo ir kontroliniаi krаujo mėginiаi surinkti 2005-2013 metаis Lietuvos ir Lаtvijos gаstroenterologijos centruose. DNR iš periferinių kraujo leukocitų i[...].