Use this url to cite ETD: https://hdl.handle.net/20.500.12512/118227
FAS and FASL Gene Variant Analysis and their Effect on Cervical Cancer Prognosis Assessment
Type of publication
type::text::thesis::master thesis
Title
FAS and FASL Gene Variant Analysis and their Effect on Cervical Cancer Prognosis Assessment
Other Title
FAS ir FASL genų variantų nustatymas ir sasaju su gimdos kaklelio vėžio prognoze analizė
Advisor
Other(s)
Recenzentas / Reviewer | |
Komisijos pirmininkas / Committee Chairman | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Extent
40 p.
Thesis Defence Date
2023-06-13
Abstract (lt)
Aim: The research aims to analyse DNA sequence variation in FAS rs2234767 and FASL rs763110, and their effect on cervical cancer patient prognosis. Objectives:
- To examine the distribution of alleles and genotypes in FAS rs2234767 and FASL rs763110.
- To assess the relationship between rs2234767 and rs763110 variants and tumour pathomorphological characteristics.
- To determine the associations between rs2234767 and rs763110 variants and cervical cancer prognosis. Methodology: A retrospective study of cervical cancer patients (n=172) was conducted at the Lithuanian University of Health Sciences, Oncology Institute. The research protocol was approved by the Kaunas Regional Biomedical Research Ethics Committee (protocol No. BE-2-10 and No. P1-BE-2-10/2014) and the Lithuanian University of Health Sciences Bioethics Centre (protocol No. BEC-MF-281). In this study genomic DNA was extracted from peripheral blood and the polymorphisms of FAS rs2234767 and FASL rs763110 were analysed with polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay. Patient clinical data was pre-obtained from clinical records. The statistical data analysis was performed using the IBM SPSS program. Results: The distribution of tumour pathomorphological characteristics in patients with cervical cancer: 64.0% of patients had T1 + T2 tumours, less than half of the study group (44.8%) presented with lymph node involvement, whilst 94.2% had cervical cancer without metastasis and G1 + G2 tumours were identified in 72.7% the study group. There were no statistically significant associations determined between the SNPs genotypes and the pathomorphological features of cervical tumours, progression-free survival (PFS) and overall survival (OS). However, a significant association was determined by Pearson’s Chi-square test between FASL rs763110 T allele carriers and age at the time of diagnosis (p = 0.021). The association was confirmed in the univariate logistic regression (OR = 0.489, 95% CI 0.265-0.900, p = 0.021). Carriers of T allele were found to have a decreased risk of cervical cancer diagnosis at older age compared T allele non-carriers. Conclusions:
- The distribution of alleles and genotypes in FAS rs2234767 and FASL rs763110 polymorphisms was as follows: • rs2234767 polymorphism: GG – 82.0% and GA – 18.0%; • rs763110 polymorphism: C allele – 72.7%, T allele – 27.3%, CC - 54.7%, CT – 36.0%, TT – 9.3%.
- There was no significant association between rs2234767 and the pathomorphological features of cervical tumours. A statistically significant difference between FASL rs763110 and age at time of diagnosis was observed only in the allelic model. The carriers of T allele were associated with a lower risk of cervical cancer diagnosis at older age; however, it was not an independent factor.
- There were no significant associations determined between rs2234767 and rs763110 variants and cervical cancer prognosis.
Abstract (en)
Tyrimo tikslas: nustatyti FAS rs2234767 ir FASL rs763110 genų sekos variantus ir jų įtaką gimdos kaklelio vėžiu sergančių pacienčių naviko fenotipui ir prognozei. Uždaviniai:
- Ištirti FAS rs2234767 ir FASL rs763110 alelių ir genotipų pasiskirstymą.
- Įvertinti ryšį tarp rs2234767 ir rs763110 variantų ir naviko patomorfologinių charakteristikų.
- Nustatyti sąsajas tarp rs2234767 ir rs763110 variantų ir gimdos kaklelio vėžio prognozės. Tyrimo metodika: LSMU MA MF Onkologijos institute atliktas retrospektyvus gimdos kaklelio vėžiu sergančių pacientų (n=172) tyrimas. Tyrimo protokolas patvirtintas Kauno regiono biomedicininių tyrimų etikos komiteto (prot. Nr. BE-2-10 ir Nr. P1-BE-2-10/2014) ir LSMU Bioetikos centro (protokolo Nr. BEC-MF-281). Atliekant tyrimą genominė DNR buvo išskirta iš periferinio kraujo, o FAS rs2234767 ir FASL rs763110 polimorfizmai buvo tirti taikant polimerazės grandininės reakcijos – restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmo (PGR-RFIP) metodą. Paciento klinikiniai duomenys buvo iš anksto gauti iš klinikinių įrašų. Statistinė duomenų analizė atlikta IBM SPSS programa. Rezultatai: Navikų patomorfologinių charakteristikų pasiskirstymas tarp pacienčių, sergančių gimdos kaklelio vėžiu: 64,0% pacientų sirgo T1 + T2 navikais, mažiau nei pusė tiriamosios grupės (44,8%) turėjo naviką su limfmazgiais, tuo tarpu 94,2% sirgo gimdos kaklelio vėžiu be metastazių ir G1 + G2 navikai buvo nustatyti 72,7% tiriamosios grupės. Statistiškai reikšmingų sąsajų tarp SNP genotipų ir patomorfologinių savybių, išgyvenamumo be progreso (PFS) ir bendro išgyvenamumo (OS) nebuvo nustatyta. Tačiau statistiškai reikšminga sąsaja buvo identifikuota tarp FASL rs763110 T alelio ir amžiaus diagnozės nustatymo metu (Chi kvadrato testas; p = 0.021). Logistinės regresijos analizė parodė, kad T alelio nešiojai turėjo mažesnę riziką susirgti gimdos kaklelio vėžiu vyresniame amžiuje lyginant su T alelio nenešiotojais (OR = 0.489, 95% CI 0.265-0.900, p = 0.021). Išvados:
- Alelių ir genotipų pasiskirstymas FAS rs2234767 ir FASL rs763110 polimorfizmuose buvo toks: • rs2234767 polimorfizmo: GG – 82 % ir GA – 18 %. • rs763110 polimorfizmo: C alelis – 72,7%, T alelis – 27,3%, CC - 54,7%, CT – 36,0%, TT – 9,3%.
- Reikšmingų sąsajų tarp rs2234767 ir gimdos kaklelio vėžio patomorfologinių savybių nebuvo nustatyta. Statistiškai reikšminga sąsąja tarp FASL rs763110 ir klinikopatologinių savybių buvo nustatyta tik aleliniame modelyje. T alelio nešiotojai turėjo mažesnę riziką susirgti gimdos kaklelio vėžiu vyresniame amžiuje, tačiau šis veiksnys nėra nepriklausomas.
- Reikšmingų sąsajų tarp rs2234767 ir rs763110 variantų ir gimdos kaklelio vėžio prognozės nebuvo nustatyta.
Publisher
Lietuvos sveikatos mokslų universitetas
Language
Anglų / English (en)
Defended
Taip / Yes
Access Rights
Atviroji prieiga / Open Access